Σύμφωνα με την υπ’ αριθμ. 8315.2/02/07/2007 κοινή υπουργική απόφαση (Β’ 202), ο Λιμένα χαρακτηρίζεται ως μείζονος σημασίας. Ακολούθως, σύμφωνα με το άρθρο 19ο παρ. 4 περ. ε’ και την παρ. του ν. 2932/2001, ο Λιμένας υποχρεούται να καταρτίσει πρόγραμμα έργων ανάπτυξης λιμένα (ΠΕΑΛ) και στρατηγική μελέτη περιβαλλοντικών επιπτώσεων (ΣΜΠΕ).
Ο λιμένας της Σκιάθου βρίσκεται στο παραλιακό μέτωπο της Σκιάθου και ο φορέας διαχείρισής του είναι το Δημοτικό Λιμενικό Ταμείο Σκιάθου
Σύμφωνα με το άρθρο 159 του ν. 4635/2019 σε συνδυασμό με την υπ’ αριθμ. 3000.0/87202/2023 απόφαση του Υπουργού Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής (ΦΕΚ B’ 7380/27.12.2023), το ΤΑΙΠΕΔ ενεργεί ως Αρχή Σχεδιασμού, κατά την έννοια της περιβαλλοντικής νομοθεσίας [σύμφωνα με την κοινή υπουργική απόφαση ΥΠΕΧΩΔΕ/ΕΥΠΕ/οικ. 107017 (Β΄1225/2006)] για τον Λιμένα Σκιάθου.